レオサーバーで検証した結果、Alpha Pluginのインストールはできるのですが、パーミッション問題のため、Alpha テーマインストール、アップデート機能が使えません。管理画面にAlpha Pluginのメニューが表示されないのもこのためです。
レオサーバーでALPHAを使用する場合は、ALPHA本体（zipファイル）をダウンロードしてインストールしていただきますようお願い致します。また自動アップデートが使えませんので、定期的に新しいテンプレートと入れ替える必要がありますことをご了承願います。